Nat Methods：DNA/RNA分子定量新技术
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2013-01-17
近日来自瑞典医科大学卡罗琳斯卡医学院的研究人员开发了一种分子定量新方法，相关研究论文在线发表在11月20日《自然方法》（NatureMethods）杂志上。
生物通报道近日来自瑞典医科大学卡罗琳斯卡医学院的研究人员开发了一种分子定量新方法，相关研究论文在线发表在11月20日《自然方法》（NatureMethods）杂志上。领导这一研究的是卡罗林斯卡研究院的生物化学和生物物理学家StenLinnarsson和生命科学与营养学系JussiTaipale教授。
DNA和RNA是细胞中遗传信息的重要承载者和传递者，实现对不同种类的DNA和RNA分子的精确定量成为了分子生物学一项基础任务。因此，改良这些分子检测技术对了解正常细胞和癌细胞中的生理和病理机制具有非常重要的意义。由于目前的技术尚无法直接对复合物中的少量个别分子进行检测，研究人员常采用扩增技术来获得大量拷贝分子以放大信号。然而这种扩增方法却很难实现精确追踪模板初始分子数。其原因在于相同分子扩增获得的所有拷贝彼此无法区分，因而不能确定每个初始分子的具体拷贝次数。
在这篇文章中，研究人员开发出一种新方法对这些分子进行人工标记，使得生成的拷贝能够很容易区分出它们的初始分子。随后研究人员利用一种可并行读取数百万DNA片段的新型高通量测序仪高效完成了对这些分子的定量。目前采用的多种方法均只能检测样品间的相对差异，新技术原理非常的简单，却可实现对细胞样品中的分子精确定量。JussiTaipale教授的研究团队随后利用这一技术完成了对细胞中数千种不同mRNA分子的同步定量检测，检测数据表明新技术显示了比当前类似常用技术更高的准确性。高效准确的计数mRNA分子具有重要的意义，通过定量它们的丰度即可了解到靶细胞中的基因表达情况。Taipale实验室长期从事细胞生长调控研究，他们希望能借助于这一技术来了解在正常及癌变等异常情况下细胞中的基因活性表达。
新技术在对少量细胞进行分子定量方面显示了特别的优势，StenLinnarsson计划将其应用到对单细胞的分子定量中去——是一个令人感到兴奋且具有挑战性的工作。此外，研究人员表示新技术的原理也可适用于改良其他重要的检测技术，帮助开发出更高精确度的基因组测序技术。（生物通：何嫱）
