中国人参基因组计划取得新进展
查字典生物网
2013-01-16
中国医学科学院药用植物研究所所长陈士林教授日前在吉林长春表示，中国人参基因组计划自2010年4月正式启动以来，已完成人参根、茎、叶和花的转录组测序，并已发现所有与人参皂苷合成相关酶的候选基因。
陈士林介绍，中国人参转录组和人参皂苷合成机制研究，处于世界领先水平。目前，研究人员已利用高通量测序技术对四倍体人参基因组进行测序，测序深度达到人参基因组大小的10倍以上；完成人参根、茎、叶和花的转录组测序，共获得序列200多万条；已发现所有与人参皂苷合成相关酶的候选基因，为阐明人参皂苷的生物合成机制及人参皂苷的代谢工程研究，奠定了坚实基础。
他还介绍，人参基因组巨大，基因组重复序列多、复杂度高，为研究工作带来巨大挑战。研究表明，人参为高度杂合的4倍体，含48条染色体，一套染色体的大小约为3．2Gb，与人类基因组大小相似；其基因组GC含量约45％，重复序列比例约60％。以基因组大小仅为人参的1／10的黄瓜为例，我国研究者采用高通量测序方法，利用近3年时间，花费2000多万元人民币，才完成基因组测序工作。可见，人参基因组计划工作任务艰巨。
中国人参基因组计划，由中国医学科学院药用植物研究所、中国农业科学院特产研究所、天津中医药大学等多家单位参与。该计划包括：人参全基因组序列的初步测定和拼接，人参不同生长发育阶段和不同组织部位转录组的测定和分析、人参基因组和转录组的注释和功能基因发现，克隆和鉴定人参皂甙生物合成和调控相关基因等。
